2008-2018年遼寧省腸道病毒71型流行特征與VP1區基因特征分析

摘要：目的了解遼寧省的腸道病毒71型的流行特征并對VP1區基因特征進行分析。方法用2008—2018年遼寧省14個市送檢的手足口病患者的陽性標本,通過細胞培養法分離腸道病毒,提取病毒RNA,用RT-PCR法對腸道病毒VP1區基因擴增和序列測定。利用BLAST對測序結果比對后確定病毒基因型別。對鑒定為EV71的分離株進行VP1區同源性分析,并構建系統進化樹。結果遼寧省在2008—2018年間實驗室總計收到陽性標本24749份,其中最多的是其它腸道病毒(43.77%);其次是CA16(32.67%);EV71(23.2%)。隨機原則選取66株EV71毒株,核苷酸同源性為94.80%~99.80%,氨基酸的同源性為98.50%~100.00%;與C4a參考株的同源性最高,核苷酸的同源性為94.00%~98.00%,氨基酸的同源性為98.50%~100.00%;系統進化樹分析表明,遼寧省EV71分離株為C4a基因亞型。結論EV71是引起遼寧省手足口病的重要病原體,是引起重癥及死亡病例的優勢病原;EV71分離株為C4a基因亞型,并且在遼寧省內有多個傳播鏈共同流行。