植原體感染前后毛泡桐葉綠體全基因組測序分析

摘要：以毛泡桐(Paulownia tomentosa)病苗(Pto)和健康苗(PtoI)為試驗材料,利用高通量測序技術對染病前后毛泡桐的葉綠體全基因組進行測序,分析比較基因組結構。研究結果表明,毛泡桐病苗和健康苗的葉綠體基因組由反向重復區(IRs)、長單拷貝序列區(LSC)和短單拷貝序列區(SSC)等部分組成。其中,葉綠體基因組全長分別為154 700 bp(Pto)和154 646 bp(PtoI),IRs的長度為25 779 bp,LSC和SSC長度分別為85 356、17 786 bp(Pto)和85 356、17 732 bp(PtoI)。生物信息學分析表明,在Pto中共搜索到簡單重復位點(SSR)64個,單核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸和五核苷酸的數量分別為49、5、2、7、1個;PtoI中共有64個SSR位點,單核苷酸個數為49個,并未發現六核苷酸。大多數位點都富含A-T,具有堿基偏好性。