利福平和甲基磺酸甲酯對感染植原體毛泡桐中長鏈非編碼RNA變化的影響

摘要：為研究與泡桐叢枝病相關的長鏈非編碼RNAs(lncRNAs),以毛泡桐(Paulownia tomentosa)的健康苗、患叢枝病的病苗及分別用100 mg·L^-1的利福平和60 mg·L^-1甲基磺酸甲酯處理病苗得到的處理苗為試驗材料,利用高通量測序技術研究病健苗及試劑處理苗中的lncRNAs及相應靶基因的表達情況。共鑒定出3 700個lncRNAs,2 219個靶基因,從中得到389個差異表達的lncRNAs和對應的203個靶基因,并對其靶基因進行了GO功能分類。通過方案設計鑒定得到3個與泡桐叢枝病相關的lncRNAs,預測其對應的靶基因分別為磷脂酶D、蛋白磷酸酶以及WNK賴氨酸缺乏蛋白激酶。采用實時定量PCR技術驗證隨機挑選的5個lncRNAs及其靶基因,驗證結果與高通量測序結果一致。