病毒感染海洋球石藻Emiliania huxleyi的轉錄組分析

摘要：海洋球石藻Emiliania huxleyi及其特異性裂解病毒E.huxleyi virus(EhVs)在調節海洋碳、硫循環及全球氣候變化中起著重要作用,也是開展真核生物病毒–宿主相互作用研究的良好模型系統之一。為了探究病毒感染條件下E.huxleyi基因表達水平的變化,以海洋球石藻E.huxley–BOF 92及其專一性裂解病毒EhV-99B1為研究對象,利用Illumina HiSeq 2000高通量測序技術,分別對E.huxleyi病毒感染組(Exp)和非感染對照組(Con)6 h和45 h的藻細胞樣品進行轉錄組測序分析。共得到32909條平均長度為1153 bp的基因。病毒感染6 h和45 h分別得到2617和5229個差異表達基因,其中共差異表達基因465個。隨機選取10條差異表達基因,采用qRT-PCR進行實驗驗證,結果證實轉錄組分析可靠。GO功能注釋和KEGG通路富集,發現大量基因與氧化應激反應、脂類代謝、碳水化合物代謝及信號轉導等代謝過程相關,其中變化最顯著的是谷胱甘肽代謝途徑。從病毒感染球石藻轉錄組中篩選出部分與氧化應激反應相關的基因,其中9個基因顯著上調,11個基因顯著下調,表明宿主能夠通過體內的氧化應激反應響應病毒脅迫。