短密木霉降解咪唑乙煙酸候選基因的篩選

摘要：為探明短密木霉(Trichoderma brevicom pactum)降解咪唑乙煙酸的分子機制,通過轉錄組學和蛋白質組學數據整合分析篩選降解咪唑乙煙酸的候選基因。結果顯示:以500mg/kg咪唑乙煙酸馴化后的短密木霉為材料,分別在基礎培養基和以咪唑乙煙酸為單一碳源的培養基中培養至降解效率最高的第7天,在轉錄組學中差異表達的基因1329個,其中上調703個,下調626個。用ITRAQ進行蛋白質組學分析,共鑒定到21883條肽段和4003個蛋白質。關聯分析中,鑒定出24個在轉錄組和蛋白質組中均差異表達的基因,其中14個基因上調,10個基因下調。定量蛋白質和基因的表達關聯系數為-0.0472,顯著差異蛋白質和顯著差異基因表達關聯系數為-0.1420,蛋白質和表達變化趨勢相同的基因關聯系數為-0.7413,蛋白質和表達變化趨勢相反的基因關聯系數為-0.7916。關聯分析鑒定的24個基因中,有2個基因具有功能注釋,分別為TBU3981A(NCBInr:綠色木霉Gv29-8糖苷水解酶16家族部分mRNA)和TBU1425A(NCBInr:HEX-1),可作為降解咪唑乙煙酸的候選基因。