胃癌轉移的分子特征分析及預后評估

摘要：目的利用生物信息學分析轉移性胃癌和原位胃癌的在分子水平的差異,揭示轉移性胃癌進展機制,為精準診療和預后評估提供潛在的分子靶點。方法從TCGA公共數據庫獲取胃癌患者RNA-Seq及DNA甲基化芯片數據,篩選轉移性胃癌和原位胃癌在兩個組學維度的一致性差異基因,評估其功能及富集通路并進行風險回歸分析。結果篩選出一致性差異基因170個,轉移組上調基因52個、下調基因118個。功能分析提示免疫調節、細胞分化、外源信號感應、自噬與溶酶體轉運、藥物及蛋白代謝等信號通路與轉移性胃癌發生有關。針對上述基因進行預后風險評估,發現RTP3、GTF3C5、TMEM102、NHLRC3、FUT2、PGAP2、AAMP是與轉移風險相關的7個關鍵基因,其聯合表達信號可用于胃癌患者的預后評估。結論由7個關鍵基因組成的聯合因子可為胃癌預后評估提供依據,是臨床檢測的潛在生物學標記物。