野生矮牡丹高通量轉(zhuǎn)錄組測序分析

摘要：為探究野生稷山矮牡丹(Paeonia jishanensis)花青素等抗氧化活性物質(zhì)生物合成的遺傳基礎(chǔ),本文采用高通量測序技術(shù)Illumina NextSeqTM500對(duì)其幼嫩葉片、嫩莖和花芽混合池樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序分析。共獲得39450個(gè)unigene,其中3563個(gè)unigene中有4106個(gè)SSR位點(diǎn)。在Swiss Prot數(shù)據(jù)庫中注釋到29420個(gè)unigene,其中11個(gè)與花青素生物合成過程相關(guān),22個(gè)與類黃酮生物合成過程相關(guān),15個(gè)與異黃酮生物合成過程相關(guān);NR數(shù)據(jù)庫中注釋高達(dá)100%,有12個(gè)與類黃酮生物合成相關(guān),7個(gè)與花青素生物合成相關(guān);GO數(shù)據(jù)庫中注釋到24291個(gè)unigene,分為生物學(xué)過程、細(xì)胞組分及分子功能等三大類53個(gè)功能組,有21個(gè)unigene與黃酮、黃酮醇及異黃酮生物合成有關(guān),4個(gè)unigene與花青素合成有關(guān);eggNOG數(shù)據(jù)庫中注釋到38238個(gè)unigene,涉及植物生長發(fā)育過程絕大多數(shù)生命活動(dòng)過程;KEGG數(shù)據(jù)庫注釋到5709個(gè)unigene,分別定位到6大類別42個(gè)代謝途徑,其中25個(gè)unigene與花青素生物合成相關(guān)。研究表明,在稷山矮牡丹轉(zhuǎn)錄組序列中,共鑒定和發(fā)掘出多個(gè)涉及類黃酮化合物生物合成、花青素生物合成過程的相關(guān)基因序列及SSR位點(diǎn),為下一步開展相關(guān)代謝合成途徑研究奠定了基礎(chǔ)。