miR-125a/125b基因家族進(jìn)化分析及其在豬睪丸組織中的表達(dá)變化

摘要：采用生物學(xué)信息方法在miRBase中搜索動(dòng)物miR-125a/125b基因家族序列,利用Ensembl數(shù)據(jù)庫(kù)信息確定miR-125a/125b在基因組中的位置,采用MEGA 5.0構(gòu)建miR-125a/125b家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹,并利用qRT-PCR檢測(cè)miR-125a和miR-125b在沙子嶺豬睪丸組織不同發(fā)育時(shí)期(D1、D30、D60、D90、D120、D150、D180)的表達(dá)變化。結(jié)果在miRBase數(shù)據(jù)庫(kù)檢索29個(gè)物種共58條miR-125家族序列,分布廣泛,且有高度的保守性,除一個(gè)位于內(nèi)含子區(qū),兩個(gè)位于外顯子區(qū),其余miR-125a/125b位于基因間隔區(qū),在進(jìn)化過程中,同種物種的進(jìn)化方向具有高度的一致性,進(jìn)化速度也有所不同。qRT-PCR檢測(cè)結(jié)果顯示,miR-125a/125b在沙子嶺豬睪丸組織中不同發(fā)育時(shí)期的具有相同的趨勢(shì),即出生后其表達(dá)水平緩慢升高,保育期開始降低,性成熟期又開始呈現(xiàn)升高趨勢(shì),隨著體成熟表達(dá)量開始降低。本研究結(jié)果為進(jìn)一步探明miR-125a/125b基因家族在豬睪丸組織中的功能及作用機(jī)制奠定基礎(chǔ)。