西洋參bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族生物信息學(xué)分析

摘要：bHLH是真核生物中一類編碼轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的基因家族,在植物生長發(fā)育中具有重要的調(diào)控作用。通過對(duì)西洋參根、葉、花蕾樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,篩選其中的bHLH家族基因,利用生物信息學(xué)方法對(duì)篩選到的基因進(jìn)行表達(dá)模式、蛋白結(jié)構(gòu)、細(xì)胞定位及系統(tǒng)進(jìn)化分析。結(jié)果顯示:從西洋參轉(zhuǎn)錄組中共鑒定得到62個(gè)西洋參bHLH家族基因,這些bHLH在根、葉、花蕾中具有4種表達(dá)模式。西洋參bHLH亞細(xì)胞定位預(yù)測主要在細(xì)胞核內(nèi),所有表達(dá)產(chǎn)物均包含HLH結(jié)構(gòu)域。進(jìn)化分析顯示,西洋參中62個(gè)bHLH基因可分為18個(gè)亞類,其中第Ⅺ亞族中包含最多的bHLH成員,共包含11個(gè)bHLH蛋白;第Ⅲf、Ⅳa、Ⅲ(a+c)、Ⅰb(2)、Orphans、Ⅳb亞族中的成員數(shù)量均為1個(gè),其他亞族為2~9個(gè)。