青稞葉綠體基因RNA編輯位點的預測、鑒定與比較分析

摘要：為了闡明青稞葉綠體基因組RNA編輯位點的組成與特性,首先利用生物信息工具對青稞葉綠體基因的RNA編輯位點進行了預測,結果發現了35個分布于15個基因的編輯位點,所有編輯均為C到U的轉換,其中基因ndhB包含的編輯位點數量最多,達9個,這與其他麥類作物相似;進一步利用RT-PCR結合克隆測序,對預測的35個位點進行了實驗驗證,發現18個編輯位點被證實發生了C到U的編輯;對編輯前后編碼蛋白質的結構進行了比較分析,發現RNA編輯引起了編碼蛋白的結構變化,暗示RNA編輯可以造成編碼蛋白功能的改變。最后,將青稞葉綠體基因RNA編輯位點與栽培大麥、野生大麥的葉綠體RNA編輯位點進行了比較,發現青稞與栽培大麥的RNA編輯組成完全一樣,而野生大麥缺失了ndhA-563位點,初步印證了大麥的起源進化關系。