菠蘿R2R3-MYB基因家族鑒定與表達分析

摘要：R2R3-MYB轉錄因子參與植物眾多生命活動的調控,在植物生長發育中至關重要。本研究采用生物信息學分析方法,從菠蘿基因組中篩選鑒定R2R3-AcMYB轉錄因子,并對其基因結構、編碼蛋白和系統進化進行了分析;基于轉錄組數據和熒光定量PCR分析,研究了乙烯利處理后菠蘿頂端分生組織MYB基因的表達模式。研究結果顯示,菠蘿基因組含有103個R2R3-AcMYB轉錄因子,其中67個的基因結構組成為3(外顯子)+2(內含子),17個為2(外顯子)+1(內含子)。103個R2R3-AcMYB蛋白中,有31個偏堿性,55個顯酸性和17個呈中性。亞細胞定位預測顯示,有67個編碼蛋白定位于細胞質,20個定位于細胞核。保守基序分析發現,有91個R2R3-AcMYB的序列包含SANT結構的motif 1和motif 2。系統進化樹分析表明,81個R2R3-AcMYB轉錄因子可以分別被歸入18個亞組,其余22個R2R3-AcMYB轉錄因子則未能進行明確歸類。基于轉錄組數據和熒光定量PCR分析結果,發現菠蘿頂端分生組織中多個MYB基因的表達受到乙烯利的誘導或抑制,暗示這些基因可能參與了乙烯利誘導條件下菠蘿生長發育(包括開花誘導等)調控。這些研究結果為進一步挖掘菠蘿激素響應、生長發育和開花調控等基因,揭示菠蘿生長發育調控機制提供了數據支持。