基于傳統培養和宏基因組測序分析泗洪小龍蝦不同部位的菌群多樣性

摘要：通過傳統培養和宏基因組測序方法分析泗洪地區小龍蝦整體、表面、尾肉等不同部位的菌群多樣性,確定不同部位的特定污染菌組成。結果表明:小龍蝦整體的初始菌數達8.4(lg(CFU/g)),且不同部位的微生物群落有明顯差異;通過宏基因組測序發現,在科水平上,黃桿菌科(Flavobacteriaceaea)是泗洪小龍蝦不同部位的優勢菌科,叢毛單胞菌科(Comamonadaceae)、莫拉氏菌科(Moraxellaceae)和氣單胞菌科(Aeromonadaceae)分別是小龍蝦整體、表面和尾肉的優勢菌科;在屬水平上,金黃桿菌屬(Chryseobacterium)、不動桿菌屬(Acinetobacter)和氣單胞菌屬(Aeromonas)分別是小龍蝦整體、表面和尾肉的優勢菌屬,黃桿菌屬(Flavobacterium)在3個部位中相對豐度均較高。