基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序探索創(chuàng)傷弧菌MO6-24/O小RNA

摘要：目的:基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序注釋,探索創(chuàng)傷弧菌MO6-24/O小RNA(sRNA)。方法:在海洋培養(yǎng)基2216E中培養(yǎng)創(chuàng)傷弧菌MO6-24/O,收集從對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期到靜止期不同時(shí)間點(diǎn)的細(xì)菌,提取細(xì)菌RNA,通過富集sRNA以及去除核糖體RNA進(jìn)行建庫和測(cè)序,然后將讀段匹配到創(chuàng)傷弧菌MO6-24/O基因組并進(jìn)行注釋,最后進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果:發(fā)現(xiàn)59個(gè)順式編碼sRNA、102個(gè)反式編碼sRNA,并進(jìn)行了部分驗(yàn)證。結(jié)論:鑒定出創(chuàng)傷弧菌MO6-24/OsRNA。