采用GBS-seq技術構建甜瓜高密度遺傳圖譜

摘要：【目的】構建甜瓜高密度遺傳圖譜,為研究甜瓜重要性狀基因定位及功能分析奠定基礎。【方法】以甜瓜材料K7-4(高抗霜霉病)和K7-2(高感霜霉病)為親本,雜交再自交得到F 2分離群體。構建GBS文庫并進行雙末端測序,使用滑動窗口的方法進行基因型分型,SAM TOOLS軟件檢測SNP位點,采用Joinmap 4.0軟件進行排圖,用perl SVG模塊繪制連鎖圖,用win QTL cart 2.5進行QTL檢驗,根據復合區間作圖法,使用R/qtl軟件包進行QTL定位。【結果】構建了總長為4823.55 cM的遺傳圖譜,標記間平均遺傳距離為1.43 cM。在苗期、生長中期和生長后期共檢測到26個與甜瓜霜霉病性狀相關的QTL。【結論】基于GBS-seq技術獲得了甜瓜高密度遺傳圖譜,最終將抗霜霉病基因關聯到CM3.5.1_scaffold00005上的6,831,227~7,830,935 bp,約1Mb的區間范圍內。