雨生紅球藻UVR8的基因克隆和生物信息學分析

摘要：【目的】獲得雨生紅球藻中紫外抗性蛋白(Uvresistance locus 8,UVR8)的cDNA序列全長,并進行生物信息分析。【方法】以雨生紅球藻為研究對象,通過同源克隆方法獲得紫外抗性蛋白UVR8的cDNA序列全長,并通過生物信息手段對其理化性質、蛋白結構及系統進化進行分析。【結果】序列分析表明,HaeUVR8的編碼區全長為1554 bp,共編碼517個氨基酸,預測理論等電點為5.56,理論分子量為54.31 kD。通過BLASTp分析,與擬南芥中UVR8的相似性達到51%,與萊菌衣藻中UVR8的相似性達到59%。通過蛋白保守結構域分析,HaeUVR8蛋白中存在UVR8蛋白的典型結構域,包括7個葉片螺旋結構和保守的色氨酸殘基。系統進化分析表明,高等植物和真核綠藻來源UVR8s有共同祖先。【結論】本研究首次獲得雨生紅球藻中編碼UVR8的基因序列,發現其結構與高等植物UVR8相似,暗示二者可能有相似的作用機制,為雨生紅球藻中UVR8的表達、功能研究奠定基礎,同時為解析雨生紅球藻適應紫外光的分子機制提供線索。