基于生物信息學分析胰腺癌的關鍵基因

摘要：目的利用生物信息學分析胰腺癌發生、發展的關鍵基因,為胰腺癌的早期診斷、預后評估及靶向治療提供理論依據。方法從GEO數據庫中獲取GSE15471基因芯片數據集,在線分析工具GEO2R篩選差異表達基因,并對差異表達基因進行GO、KEGG富集分析和蛋白互作網絡分析,利用Cytoscape軟件的cytoHubba插件篩選出關鍵基因,通過GEPIA數據庫對關鍵基因再次驗證。結果從GSE15471基因芯片中共篩選出267個顯著差異表達基因,其中上調基因232個,下調基因35個。富集分析顯示差異表達基因主要涉及細胞黏附、PI 3K-Akt信號通路、蛋白水解、炎性反應、膠原分解代謝、免疫反應等。通過蛋白互作網絡篩選出11個關鍵基因,下調基因ALB、EGF,上調基因MMP2、CXCL8、FN1、COL1A1、SPP1、MMP1、ITGA2、COL3A1、CRP。GEPIA數據庫中關鍵基因表達情況與基因芯片分析結果一致,生存分析顯示胰腺癌患者總生存時間與MMP1、ITGA2基因表達高低相關。結論生物信息學篩選出的11個關鍵基因在胰腺癌的發生、發展中有重要作用,是潛在的胰腺癌特異腫瘤分子學標志物和靶向治療新位點。