細粒棘球絳蟲Calpain蛋白的生物信息學分析

摘要：目的采用生物信息學軟件分析細粒棘球絳蟲Calpain蛋白(EgCalpain)的結構與抗原表位,為研制基于Calpain的棘球蚴病疫苗提供依據。方法從NCBI核苷酸和蛋白質數據庫下載EgCalpain的核苷酸和氨基酸序列,采用ProtParam、SignalP、TMHMM、Cell-Ploc等在線分析程序,結合DNAStar、DNAMAN等生物信息學軟件分析、預測EgCalpain蛋白的理化性質、信號肽序列、跨膜結構域、亞細胞定位及抗原表位;采用Clustal omega程序對不同物種來源的Calpain蛋白進行多序列比對,并通過MEGA 6.06程序構建鄰接樹。結果 EgCalpain基因全長7 734 bp,包含15個外顯子和14個內含子;EgCalpain基因編碼蛋白由707個氨基酸組成,是一種穩定蛋白,不含有信號肽序列和跨膜區域,可能定位于細胞質。EgCalpain蛋白含有5個T、B細胞聯合表位,分別為267-299 aa、328-356 aa、486-507 aa、546-567 aa、648-662 aa。EgCalpain蛋白與曼氏血吸蟲Calpain的親緣關系較近,與人、牛、羊Calpain的親緣關系較遠。結論 EgCalpain蛋白含有5個T、B細胞聯合表位且與人、牛、羊Calpain的親緣關系較遠,作為棘球蚴病疫苗進行免疫時,可能具有良好的免疫保護作用。