基于COSMIC數據庫的結直腸轉移性癌的體細胞突變基因變化的研究

摘要：目的利用癌癥體細胞突變目錄(COSMIC)數據庫,篩選結直腸原發性癌和結直腸轉移性癌兩類癌組織之間的具有顯著差異的體細胞基因突變,并分析其可能的功能及通路。方法從COSMIC數據庫下載結直腸癌全外顯子測序數據,在R 3.5.0環境下,利用卡方檢驗或Fisher確切概率法對結直腸原發性癌和結直腸轉移性癌兩類癌組織之間的差異體細胞突變基因進行挖掘,記錄具有顯著差異的體細胞突變基因并進行功能及通路富集分析,探索其可能生物學功能及通路。結果共發現120個具有顯著差異的體細胞突變基因,包括RHEB、RP11-368J21.2、AGAP10等,對其進行GO和KEGG富集分析顯示,這些顯著性差異體細胞突變基因可能與如脫氫酶活性、還原酶活性、細胞周期停滯、代謝途徑、PI3K-Akt信號通路、細胞周期、細胞粘附分子、癌癥中的轉錄失調、鉑類耐藥性等功能及通路相關。結論挖掘結直腸原發性癌和結直腸轉移性癌之間的顯著差異體細胞突變基因可為研究結直腸癌的轉移調控機制提供借鑒,顯著差異體細胞突變基因可能作為結直腸癌轉移診斷標志物或轉移治療靶點應用于臨床。