基于原噬菌體類型的我國柑橘黃龍病菌種群遺傳結(jié)構(gòu)分析

摘要：柑橘黃龍病是柑橘生產(chǎn)上最嚴(yán)重的病害之一,由難培養(yǎng)的候選韌皮部桿菌亞洲種('Candidatus Liberibacter asiaticus',CLas)引起。目前,已報(bào)道的與CLas相關(guān)的原噬菌體有3種,并且不同的CLas樣品中可以檢測到不同類型的原噬菌體或不同類型的組合。本研究基于原噬菌體類型特異引物對(duì)從我國南方8省收集的548個(gè)黃龍病樣品進(jìn)行原噬菌體類型的鑒定和分析。結(jié)果表明,基于原噬菌體類型,在548個(gè)樣品中共鑒定了7種類型的菌株,分別為Type 1(7.12%)、Type 2(60.22%)、Type 3(3.83%)、Type 1+Type 2(3.28%)、Type 1+Type 3(17.34%)、Type 1+Type 2+Type 3(3.47%)和None類型(不含上述3種類型原噬菌體)(4.74%),其中只攜帶Type 2類型原噬菌體菌株為華南地區(qū)優(yōu)勢(shì)種群。此外,基于遺傳多樣性和遺傳距離對(duì)我國南方地區(qū)的CLas種群進(jìn)行種群結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),我國南方地區(qū)的CLas種群可以分為3個(gè)組,即Ⅰ組(廣東、江西、廣西、福建)、Ⅱ組(浙江和湖南)以及Ⅲ組(云南和海南),其中Ⅰ組和Ⅱ組又可聚為一大組。該結(jié)果可為研究我國柑橘黃龍病流行規(guī)律提供一定的理論基礎(chǔ)。