DNA條形碼在熱帶龍腦香科樹種鑒定中的應用

摘要：龍腦香科植物是東南亞地區重要的熱帶木材來源樹種,對其開展DNA條形碼評估在林業監管及森林資源保護等方面具有非常重要的實際應用價值。通過對龍腦香科植物樣品進行rbcL、matK、trnL-trnF和ITS2四個片段的擴增和測序,結合GenBank下載的數據,共獲得龍腦香科樹種14屬244種共計899條序列。通過比較4個片段的通用性、序列特征、種內和種間的遺傳變異,基于Best Match (BM)、Best Close Match (BCM)、相似性搜索算法(BLAST)和鄰接樹(NJ) 4種方法評估DNA條形碼對于龍腦香科樹種的鑒定能力。結果表明, ITS2在龍腦香科樹種中鑒定效率最高,通過優化的擴增體系能夠從該科植物葉片中獲得較高質量的ITS2片段;葉綠體matK片段擴增和測序效率為100%,且種內及種間遺傳變異明顯,鑒定成功率高于其它葉綠體片段,并據此提出ITS2和matK適合作為龍腦香科樹種的DNA條形碼。